Inti Creates開発・Capcom発売、2003年11月に米国で発売されたGBA向けメガマンゼロ続編。ゼロが残酷なハルピュイアとその軍団が支配するようになったネオアルカディアに対する戦いを続ける。Sランクでボスを倒して得る新しいEXスキル、充実したサイバーエルフシステム、サイバートロニクス、依然として要求の高い難易度。システム改善が評価された第2弾。
『Mega Man Zero 2』のPAL欧州版で、第一作で導入されたサイバーエルフ体系を整理し、カスタマイズ可能なフォーム要素を新規導入、以降のZero 3・4のゲームプレイ基盤を構築する。Capcom欧州出荷は短く、欧州紙箱は脆く、PAL識別+説明書揃いの完品はGBA四部作を同一地域版で揃えたいInti Creates完集勢に明確に評価される。