Inti Creates開発・Capcom発売、2004年4月に日本で発売されたGBA向けロックマンゼロ第3弾。ゼロがさらに危険な敵と戦う中でオメガとDr.ワイルの起源が明らかになる。ゼロの外見と能力を変えるフォームシステム、印象的なボス、重要な啓示のあるシナリオ。シリーズ最高傑作と見なされる西洋でMega Man Zero 3として知られる日本版。
『Rockman Zero 3』の日本初版で2004年4月発売、サブフランチャイズの構造的頂点として評価され、Recipeサイバーエルフ体系導入直前の最終形を担う。カプコンプラケースと専用帯、PAL版より明確に彩度の高い中山徹ジャケットを備える。日本出荷は市場規模に応じ、帯付き完品は原典印刷を重視する津田組ファンに明確に評価される。